協會秘書處是在協會會員大會、理事會等領導機構閉會期間,執行其相關決議的常設辦事機構,負責處理協會日常事務工作,負責協會網站管理及編輯、出版協會會刊。根據協會章程規定,秘書長在會長領導下開展工作,對理事會負責。
秘書長行使下列職權:(一)主持辦事機構開展日常工作,組織實施年度工作計劃。(二)協調各分支機構、代表機構、實體機構開展工作。(三)提名副秘書長以及各辦事機構、分支機構、代表機構和實體機構主要負責人,交理事會決定。(四)決定辦事機構、代表機構、實體機構專職工作人員的聘用。(五)處理其他日常事務。